Les meilleurs experts-comptables spécialisés en CII innovation en 2026

31cabinets spécialisés·3.7moyen sur 6,293 avis Google·MAJ juin 2026

Le Crédit d’Impôt Innovation (CII) impose aux entreprises éligibles une traçabilité rigoureuse des dépenses de conception et prototypage, avec des postes de coûts souvent éclatés (sous-traitance R&D, amortissements de brevets, frais de personnel dédié). Les points de vigilance incluent la délimitation stricte entre CII et CIR, la justification des dépenses innovantes non technologiques, et l’optimisation des reports de crédit sur 3 ans. Un régime fiscal complexe qui exige une expertise comptable spécialisée pour sécuriser les déclarations et maximiser le montant du crédit.

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📍 Région

3.7★★★★★6143 avis Google🏆 Top 25%#001

Keobiz

29 bis rue d’Astorg·75008 Paris

✓ Ordre ECEST. 2012 · 14 ANS⭐ Fiche enrichie

Présence : Compétence cii innovation déclarée · 3,7★ (6143 avis)

Secteur: VTC chauffeur independant
Spécialités +5: lmnp lmp optimisation amortissement, cir recherche dossier complet
Services +5: tenue comptable, paie sociale, fiscalite dirigeant
Outils: qonto
Certif.: Ordre des experts-comptables

★"Je recommande vivement Keobiz et tout particulièrement Sophie Mauger, qui accompagne ma société avec un très grand professionnalisme. Sophie est toujo…"
— Eve Belhassen· Modifié il y a 2 semaines· Avis Google

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keobiz.fr

5.0★★★★★3 avis Google🏆 Top 25%#002

Expertness

7 PLACE DE L HOTEL DE VILLE·93600 Aulnay-sous-Bois

✓ Ordre EC⭐ Fiche enrichie

Spécialisation : Spécialisation marquée dans le financement de l'innovation (CIR, CII, levées de fonds).

Secteur: Startup SaaS B2B Tech
Spécialités +6: cir recherche dossier complet, cii innovation
Services +6: tenue comptable, paie sociale, fiscalite dirigeant

★"Noëlie s'occupe de plusieurs des sociétés dont je suis le gérant, elle est très réactive, pertinente dans ses recommandations et dans sa globalité trè…"
— Lucas Fougeras· il y a un an· Avis Google

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expertness.fr

4.7★★★★★58 avis Google🏆 Top 25%#003

Painvin Expertise Comptable et Audit

ZAE LES TANNES BASSES - 10 RUE DU CHARDONNAY·34800 Clermont-l'Hérault

✓ Ordre ECEST. 2008 · 18 ANS⭐ Fiche enrichie

Présence : Compétence cii innovation déclarée · 4,7★ (58 avis)

Secteur: BTP artisan
Spécialités +6: cii innovation, lmnp lmp optimisation amortissement
Services +8: tenue comptable, paie sociale, fiscalite societe

★"J'ai eu l'occasion d'effectuer un stage de gestionnaire de paie 10 semaines au sein de ce cabinet. J'ai été mise à contribution sur des tâches opérati…"
— Charlène R· il y a 8 mois· Avis Google

Voir la fiche complète →04 67 96 08 14

painvin-expert-comptable.com

3.7★★★★★3 avis Google#004

Recci Breuillet

9 BOULEVARD DU GENERAL DE GAULLE - MEREVILLE·91660 Méréville

✓ Ordre EC⭐ Fiche enrichie

Positionnement : Groupe pluridisciplinaire accompagnant les entreprises sur leur performance globale, de la comptabilité à l'innovation, en passant par le droit, le…

Spécialités +1: cir recherche dossier complet, cii innovation
Services +5: tenue comptable, paie sociale, fiscalite dirigeant

★"De mon coté je recommande ce cabinet à tous les entrepreneurs J’ai eu comme contact principal Mr A.Antraygues qui m’a conseillé lors d’un premier rdv…"
— Adil Khenniche· il y a 6 ans· Avis Google

Voir la fiche complète →01 70 61 14 10

recci.fr

5.0★★★★★24 avis Google🏆 Top 10%#005

Baker Tilly Strego

PLAINE DES VAUX - 44 RUE BERNARD PALISSY·37500 Chinon

✓ Ordre ECEST. 2011 · 15 ANS⭐ Fiche enrichie🌍 2 langues

Présence : Compétence cii innovation déclarée · 5,0★ (24 avis)

Secteur: Economie sociale solidaire
Spécialités +54: pacte dutreil, holding patrimoniale passive
Services +10: tenue comptable, paie sociale, fiscalite societe
Outils: silaepower bi
Certif.: Label Lucie 26000

★"J avais choisi BakerTilly pour m accompagner dans le lancement de mon entreprise il y a maintenant tout juste un an ! Je ne regrette absolument pas m…"
— cauzette charles· il y a 2 ans· Avis Google

Voir la fiche complète →02 47 93 16 90

bakertilly.fr

5.0★★★★★6 avis GoogleDernier : il y a 4 ans#006

YCL Expertise

16 RUE GUSTAVE EIFFEL·22360 Langueux

✓ Ordre EC⭐ Fiche enrichie

Focus : Expertise cii innovation déclarée (cabinet focalisé)

Cabinet régional breton structuré autour d'un maillage territorial fort et d'une expertise marquée en accompagnement de l'innovation.

Spécialités: cir recherche dossier complet, cii innovation
Services +8: tenue comptable, paie sociale, fiscalite societe
Outils: cegid

Installé depuis plus de 25 ans en Bretagne

Voir la fiche complète →02 96 68 06 68

yclexpertise.fr

5.0★★★★★13 avis Google🏆 Top 25%#007

Experts & Entreprises

90 RUE VENDOME·69006 Lyon (69006)

✓ Ordre ECEST. 2016 · 10 ANS⭐ Fiche enrichie

Présence : Compétence cii innovation déclarée · 5,0★ (13 avis)

Secteur: Startup SaaS B2B Tech
Spécialités +7: cir recherche dossier complet, cii innovation
Services +6: tenue comptable, paie sociale, fiscalite dirigeant
Certif.: Inscrit à l'Ordre des Experts-Comptables

Cabinet inscrit à l'Ordre des Experts-Comptables depuis 2016

Voir la fiche complète →04 78 08 03 70

finatec-expertise.com

4.7★★★★★16 avis Google🏆 Top 25%#008

Smart Expert

30 RUE DES VILLENEUVES·45170 Neuville-aux-Bois

✓ Ordre EC⭐ Fiche enrichie

Présence : Compétence cii innovation déclarée · 4,7★ (16 avis)

Cabinet d'expertise comptable digitalisé spécialisé dans l'accompagnement des startups, de la création à la levée de fonds.

Secteur: Startup SaaS B2B Tech
Spécialités +5: cir recherche dossier complet, cii innovation
Services +4: tenue comptable, paie sociale, fiscalite societe
Outils: pennylanepower bi

★"Smart Expert agit comme un véritable partenaire de l'entreprise. Nous apprécions tout particulièrement l'approche entièrement numérique du cabinet qu…"
— Edward Klein· il y a 3 ans· Avis Google

Voir la fiche complète →06 52 58 67 73

smart-expertise-comptable-startups.fr

5.0★★★★★4 avis Google🏆 Top 25%#009

Qantalis Expertise

43 RUE JEAN MOULIN·56300 Pontivy

✓ Ordre EC⭐ Fiche enrichie

Présence : Compétence cii innovation déclarée

Secteur: BTP artisan
Spécialités +3: cir recherche dossier complet, cii innovation
Services +11: tenue comptable, paie sociale, fiscalite dirigeant

5 agences implantées au cœur du Morbihan

Voir la fiche complète →02 97 25 03 11

qantalis.com

5.0★★★★★4 avis Google🏆 Top 25%#010

Inovea Expertises

55 AVENUE DES TIRIGNONS·38570 Goncelin

✓ Ordre EC⭐ Fiche enrichie

Présence : Compétence cii innovation déclarée

Spécialités +5: cir recherche dossier complet, cii innovation
Services +12: tenue comptable, paie sociale, fiscalite dirigeant
Outils: pennylanesilaepower bi

★"Cabinet d'expertise très sérieux, à l'écoute des attentes de ses clients. Toujours soucieux d'apporter une réponse aux questions. Très impliqué dans s…"
— Eric Dupuy· il y a 3 ans· Avis Google

Voir la fiche complète →06 28 34 24 26

inovea-expertises.com

5.0★★★★★3 avis Google🏆 Top 25%#011

Qantalis Expertise

374 RUE DE KERLO·56850 Caudan

✓ Ordre EC⭐ Fiche enrichie

Présence : Compétence cii innovation déclarée

Secteur: BTP artisan
Spécialités +5: cir recherche dossier complet, cii innovation
Services +10: tenue comptable, paie sociale, fiscalite dirigeant

★"Voilà une collaboration de 10 ans qui s'arrête, suite à la cession récente de notre entreprise. Nous tenions, avant de clôturer tous nos "comptes", à…"
— Patrick CAUVIN· il y a 2 mois· Avis Google

Voir la fiche complète →02 97 33 14 03

qantalis.com

5.0★★★★★2 avis Google🏆 Top 25%#012

Experts Associés Société D'expertise Comptable

89 RUE LA BOETIE·75008 Paris (75008)

✓ Ordre EC⭐ Fiche enrichie

Présence : Compétence cii innovation déclarée

Secteur: Industrie electronique
Spécialités +10: cir recherche dossier complet, cii innovation
Services +12: tenue comptable, paie sociale, fiscalite dirigeant
Outils: pennylanesagesilae

Frédéric Janvier est médiateur et arbitre indépendant formé depuis 2001.

Voir la fiche complète →01 42 25 01 40

audit-experts.fr

5.0★★★★★2 avis Google🏆 Top 25%#013

Audit Comptabilité et Informatique

80 BOULEVARD FLANDRIN·75116 Paris

✓ Ordre EC⭐ Fiche enrichie

Présence : Compétence cii innovation déclarée

Secteur: Hôtellerie
Spécialités +15: pacte dutreil, cir recherche dossier complet
Services +13: tenue comptable, paie sociale, fiscalite dirigeant
Outils: pennylanesagesilae
Certif.: Membre de l'Ordre des Experts-Comptables, Membre de la Compagnie des Conseils & Experts Financiers

Plus d'une centaine d'opérations de transmission et rapprochement d'entreprises réalisées ces dernières années.

Voir la fiche complète →01 47 27 75 75

audit-experts.fr

5.0★★★★★3 avis Google#014

Totem Expertise

4 ALLEE DE LA COMBE·69380 Lissieu

✓ Ordre EC⭐ Fiche enrichie

Présence : Compétence cii innovation déclarée

Cabinet d'expertise comptable spécialisé dans l'accompagnement des acteurs du e-commerce, du dropshipping et des solutions SaaS.

Secteur: Ecommerce marchand B2C
Spécialités +3: tva oss one stop shop ecommerce, jei jeune entreprise innovante
Services +5: tenue comptable, paie sociale, fiscalite societe

★"Un très bon contact et des conseils d'expert, je recommande les yeux fermés ! Merci"
— Christophe Cabos· il y a 2 ans· Avis Google

Voir la fiche complète →06 46 78 70 68

totem-expertise.com

5.0★★★★★2 avis Google#015

Exgo Expertise Comptable & Audit

32 RUE DE PARADIS·75010 Paris (75010)

✓ Ordre EC⭐ Fiche enrichie🌍 2 langues

Présence : Compétence cii innovation déclarée

Spécialités +2: cir recherche dossier complet, cii innovation
Services +8: tenue comptable, paie sociale, fiscalite dirigeant

Solide expérience dans la transcription en FrenchGaap des comptabilités tenues dans des ERP étrangers

Voir la fiche complète →06 15 50 76 97

exgo-audit.com

Questions fréquentes

Expert-comptable cii innovation : ce qu'il faut savoir

Comment choisir un expert-comptable spécialisé en CII Innovation pour une startup SaaS ?

Pour une startup SaaS, privilégiez un cabinet maîtrisant les spécificités des dépenses éligibles au CII (développement de fonctionnalités innovantes, tests utilisateurs, coûts de cloud computing). EXPERTS & ENTREPRISES accompagne notamment des startups tech en combinant CII et statut JEI, tandis que EXPERTNESS intègre l’optimisation des BSPCE dans la stratégie fiscale. Vérifiez leur expérience sur des dossiers similaires et leur capacité à produire des liasses fiscales détaillées (formulaire 2069-A-SD).

Quelles sont les spécificités comptables et fiscales du CII Innovation par rapport au CIR ?

Le CII se distingue du CIR par son périmètre restreint aux dépenses de conception de prototypes ou d’installations pilotes (hors recherche fondamentale). Les postes comptables à isoler incluent les frais de design industriel, les coûts de tests en conditions réelles, et les amortissements de brevets non technologiques. KHADIRI & CO et BF CONSEILS D'EXPERTS & ASSOCIES sécurisent cette distinction en produisant des annexes détaillées pour l’administration, évitant les redressements pour confusion entre les deux crédits.

Quels sont les tarifs moyens pour un accompagnement CII Innovation ?

Les honoraires varient selon la complexité du dossier : de 1 500€ à 5 000€ pour une déclaration CII isolée, incluant l’audit des dépenses et la rédaction des annexes fiscales. Pour un accompagnement annuel (comptabilité + CII + CIR), comptez 3 000€ à 8 000€/an. SMART EXPERT propose des forfaits dédiés aux startups, tandis que EXTENTIS CONSO facture à l’heure (150-200€) pour les dossiers nécessitant une analyse approfondie des brevets et prototypes.

Quels outils ou logiciels sont adaptés à la gestion comptable d’un dossier CII ?

Les outils doivent permettre un suivi analytique précis des dépenses éligibles (centres de coûts dédiés) et une traçabilité des justificatifs. INOVEA EXPERTISES utilise Pennylane pour catégoriser les frais de R&D/innovation, tandis que BAKER TILLY STREGO couple Power BI à des tableaux de bord personnalisés pour le suivi des amortissements de brevets. Les logiciels comme Sage ou Cegid (utilisé par YCL EXPERTISE) sont aussi adaptés pour les PME industrielles.

Faut-il privilégier un expert-comptable local ou un accompagnement à distance pour le CII ?

Le CII ne nécessite pas une présence physique systématique, mais un cabinet maîtrisant les enjeux sectoriels (ex : industrie vs SaaS) est crucial. ABAX CONSEILS accompagne des startups healthtech à distance via des outils collaboratifs, tandis que PAINVIN EXPERTISE COMPTABLE ET AUDIT propose des audits sur site pour les PME industrielles. Privilégiez un cabinet avec une équipe dédiée aux crédits d’impôt, quel que soit son emplacement.

Quelles sont les erreurs fréquentes à éviter dans une déclaration CII Innovation ?

Les redressements fréquents concernent l’inclusion de dépenses non éligibles (marketing, formation) ou l’absence de traçabilité des heures de personnel dédié. EXPERTS CONSULTANTS ASSOCIES et AUDIT COMPTABILITE ET INFORMATIQUE insistent sur la nécessité de conserver les fiches de temps détaillées et les contrats de sous-traitance R&D. Une autre erreur courante est la non-déclaration des subventions affectant le calcul du crédit, ce qui peut entraîner des régularisations coûteuses.

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